先天性腦積水的孩子可以出現頭顱形態異常、顱內壓升高和神經功能障礙三大方面的表現。
由于嬰兒的顱縫還沒有閉合,因此腦積水常常使嬰兒頭顱迅速增大,頭顱過大與軀干生長比例不協調,會使患兒出現臉小、前額突出、下頜尖細的容貌。如果頭部過重,頸部難以支撐,孩子表現為垂頭,通常不能坐或站立。
雖然嬰兒期顱縫未閉合對顱內壓力有一定的緩沖作用,但是隨著腦積水越來越重,出現顱內壓升高和靜脈回流受阻的表現出現前囟擴大、張力高、顱縫裂開、頭皮靜脈明顯充血、精神萎靡、煩躁不安、頭痛、惡心、嘔吐或昏睡、顱骨變薄、頭發稀少。叩診頭部可以聽見破壺音,部分患兒可以出現落日征。先天性腦積水早期不影響孩子的生長發育,進展到晚期可以出現生長發育停滯不前、智力下降、嗅覺和視力下降,嚴重者出現痙攣性癱瘓、平衡障礙、尿失禁等。