結腸炎是一個大的籠統的概念,它包括了痢疾。結腸炎可以分為特異性結腸炎和非特異性結腸炎。特異性結腸炎是指病因比較明確的結腸炎,比如感染了細菌、病毒、真菌、寄生蟲等微生物引起的腸道黏膜炎性改變。其中感染細菌中常見的有大腸埃希菌、志賀菌屬、沙門菌屬,由志賀菌屬引起的腸道感染導致的急性腸炎,我們稱為細菌性痢疾,由溶組織內阿米巴原蟲感染引起的腸炎,我們又稱為阿米巴痢疾。另外還有一些全身性疾病引起的結腸炎,比如缺血性腸病。
非特異性結腸炎是指病因不十分明確的,比如炎癥性腸病,目前研究尚未發現具體明確的病因,有研究發現可能與自身免疫性疾病相關。